L'exposition permanente du musée ramène les visiteurs dans les années 40, période de l'occupation allemande pendant la Seconde Guerre mondiale. Les salles et les murs qui constituent le décor du Musée de la Résistance néerlandaise sont remplis de photos pour aider à évoquer les années de guerre. Une grande partie de la collection est constituée d'artefacts collectés à partir des effets personnels des membres du mouvement de résistance.
L'exposition couvre toutes les formes de résistance: grèves, falsification de documents, aide à la clandestinité, journaux clandestins, itinéraires d'évasion, résistance armée et espionnage. Vous pouvez voir des poussettes dans lesquelles sont cachées des armes à feu, de fausses cartes d'identité, des machines à écrire sur lesquelles étaient tapés des messages codés et des échiquiers avec des compartiments cachés.
En plus de voir les tenants et aboutissants de la vie dans la résistance, vous verrez également à quoi ressemblait la vie quotidienne des personnes qui ont choisi de coopérer. Quelles limites l'occupation leur imposait-elle et pourquoi certains d'entre eux ont-ils décidé de rejoindre la résistance après tout ? Une autre partie importante du musée se concentre sur l'empire colonial néerlandais, les Indes orientales néerlandaises pendant la guerre. Où la population a terriblement souffert sous le régime de terreur japonais.